Молочнокислое брожение является простым расщеплением без участия кислорода, протекает с выделением незначительного количества энергии и с незначительными потерями питательных веществ.

Нежелательны для процесса силосования масляно-кислые бактерии, являющиеся строгими анаэробами. Они сбраживают углеводы, не только сахар, но и крахмал, используя для своего роста белки и другие азотные вещества силосуемой массы. Наличие масляной кислоты в силосе (даже в небольшом количестве) придает ему запах прогорклого масла. При маслянокислом брожении ухудшаются вкусовые качества силоса и происходит гнилостный распад наиболее ценной части корма— белка. Масляная кислота сама по себе не является вредной для животного организма, но при гниении белка образуются ядовитые вещества, способные вызвать отравление животных.

Нежелательными микроорганизмами являются плесневые грибы. Они развиваются только при доступе воздуха и хорошо переносят кислую среду. Плесени бурно развиваются при недостаточном уплотнении силосуемой массы, вызывают энергичный распад питательных веществ в силосуемой массе, снижая этим ее кормовую ценность и часто накапливая токсичные для животных продукты. Они разрушают молочную кислоту, накопившуюся в силосе, делая его доступным для гнилостных бактерий, которые, портят корм. При плохом укрытии силоса во. время хранения плесени портят поверхностный слой корма. Скармливание животным заплесневевшего силоса не допускается.

Одним из факторов, влияющих на процесс силосования и способствующих получению качественного силоса, является измельчение силосуемой массы. Измельчение растений способствует более интенсивному выделению сока, содержащего сахар и другие питательные вещества, необходимые для жизнедеятельности молочнокислых бактерий. Измельчение силосуемой массы повышает энергию молочнокислого брожения.